정부는 화물연대가 불법 집단행동을 벌일 경우 초기에 공권력을 투입하는 등 엄정대처키로 했다. 정부는 21일 고건 국무총리 주재로 관계장관 회의를 열고 "국민생활과 국가경제에 필수적인 화물운송을 거부하는 행위는 어떤 이유로도 용납될 수 없다"며 "도로·항만 등 주요 물류시설에 경찰력을 배치하고 불법 집단행동 가담자는 교통방해죄 및 업무방해죄로 사법처리할 방침"이라고 밝혔다. 정부는 지난 5월 합의사항이 계획대로 추진되고 있으며 운송료 인상 문제도 협상이 진행 중인 사안인 만큼 '파업을 철회하고 협상장으로 복귀하라'고 화물연대에 촉구했다. 정부는 파업으로 인한 운송 차질을 최소화하기 위해 비상 수송대책을 마련,시행에 들어갔다. 비(非)화물연대 소속 차량(전체 컨테이너 화물차 2만5천대 중 1만8천대,BCT차량 4천1백대 중 3천1백대)을 최대한 동원하고 자가용 화물차가 유료 운송행위를 하는 것도 허가해 주기로 했다. 또 여객열차 6개를 화물열차로 전환하는 등 23개 열차를 추가 투입해 화물열차 운행을 1백2개 열차에서 1백25개 열차로 확대했다. 이에 따라 컨테이너 수송열차는 50개에서 66개로,시멘트 수송열차는 52개에서 59개로 늘어나게 됐다.