기술력이 뛰어난 벤처기업들의 코스닥 상장을 도와주기 위해 올해 도입된 기술성평가제도가 논란을 빚고 있다.

심사를 받았던 업체가 부실심사 문제를 제기하며 강력하게 반발하고 있어 제도 운영을 보완해야 한다는 지적도 일고 있다.

바이오업체인 오스코텍은 최근 상장심사를 받기 위해 생명공학연구원으로부터 기술성 평가를 받았다.

이 회사는 최근 3년 매출이 평균 30억원이 안돼 기술성 평가에서 높은 점수를 받을 경우 상장심사에 유리하다는 판단에서 심사를 신청했다.

그러나 평가점수는 BB로 기대 이하였다.

이 회사 관계자는 "최근 일본의 벤처캐피털과 한국의 창업투자회사로부터 국내 바이오기업 중 가장 좋은 조건으로 투자를 유치했다"며 "생명공학연구원의 이번 심사 결과를 납득할 수 없다"고 반발했다.

증권선물거래소에 따르면 기술성 평가는 4~5명의 전문 인력이 4주에 걸쳐 수행토록 되어 있다.

그러나 실제로는 2명의 직원이 회사를 방문했을 뿐이며 그나마 평가 기간도 3주가 채 안됐다는 것이 이 회사의 주장이다.

회사 관계자는 "평가보고서에서도 평가에 대한 구체적인 근거가 누락됐다"고 지적했다.

이에 앞서 기술성 평가를 통과한 바이오니아의 경우 평가기관인 생명공학연구원과 공동으로 기술을 개발한 업체여서 평가의 공정성 논란도 있었다.

이에 대해 거래소 관계자는 "거래소가 계약을 맺은 평가기관 중 바이오기업의 기술적 평가를 할 수 있는 곳은 생명공학연구원 밖에 없었다"며 "바이오 인력을 확보하고 있는 한국기술거래소와 추가로 계약을 맺은 만큼 공정성 논란은 줄어들 것으로 본다"고 말했다.

김태완 기자 twkim@hankyung.com